Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFT74Q96LB3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFT74Q96LB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT74Q96LB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFT74Q96LB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFT74Q96LB3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms