Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNIP3Q96KP6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNIP3Q96KP6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TNIP3Q96KP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TNIP3Q96KP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNIP3Q96KP6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms