Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PGBD1Q96JS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PGBD1Q96JS3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PGBD1Q96JS3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms