Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC4Q96FT7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ASIC4Q96FT7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ASIC4Q96FT7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ASIC4Q96FT7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ASIC4Q96FT7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ASIC4Q96FT7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms