Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF501Q96CX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF501Q96CX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF501Q96CX3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF501Q96CX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF501Q96CX3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms