Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TIFAQ96CG3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TIFAQ96CG3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TIFAQ96CG3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TIFAQ96CG3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIFAQ96CG3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms