Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE4Q96A23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPNE4Q96A23 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPNE4Q96A23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CPNE4Q96A23 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms