Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCEAL3Q969E4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCEAL3Q969E4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCEAL3Q969E4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCEAL3Q969E4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCEAL3Q969E4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms