Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP9XQ93008 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP9XQ93008 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP9XQ93008 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP9XQ93008 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms