Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY07

SLC7A3, Cationic amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A3Q8WY07 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC7A3Q8WY07 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC7A3Q8WY07 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC7A3Q8WY07 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC7A3Q8WY07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms