Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3BQ8TF42 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3BQ8TF42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBASH3BQ8TF42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBASH3BQ8TF42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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