Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP33Q8TEY7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP33Q8TEY7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP33Q8TEY7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP33Q8TEY7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP33Q8TEY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms