Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEU7

RAPGEF6, Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

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Length 1,601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6Q8TEU7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
RAPGEF6Q8TEU7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
RAPGEF6Q8TEU7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.06
RAPGEF6Q8TEU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
RAPGEF6Q8TEU7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
RAPGEF6Q8TEU7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
RAPGEF6Q8TEU7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
RAPGEF6Q8TEU7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAPGEF6Q8TEU7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
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