Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROKR1Q8TCW9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PROKR1Q8TCW9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PROKR1Q8TCW9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PROKR1Q8TCW9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms