Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNIH3Q8TBE1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNIH3Q8TBE1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNIH3Q8TBE1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNIH3Q8TBE1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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