Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC112Q8NEF3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC112Q8NEF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC112Q8NEF3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CCDC112Q8NEF3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC112Q8NEF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms