Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CARFQ8N187 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARFQ8N187 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CARFQ8N187 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CARFQ8N187 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms