Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALYREFQ86V81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALYREFQ86V81 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ALYREFQ86V81 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALYREFQ86V81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALYREFQ86V81 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ALYREFQ86V81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms