Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC84Q86UT8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC84Q86UT8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC84Q86UT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC84Q86UT8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC84Q86UT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms