Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD5

SLC9B2, Sodium/hydrogen exchanger 9B2, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B2Q86UD5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC9B2Q86UD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC9B2Q86UD5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC9B2Q86UD5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC9B2Q86UD5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B2Q86UD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B2Q86UD5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B2Q86UD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B2Q86UD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B2Q86UD5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms