Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC29A4Q7RTT9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC29A4Q7RTT9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC29A4Q7RTT9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC29A4Q7RTT9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC29A4Q7RTT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 960.4 ms