Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMUB2Q71RG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMUB2Q71RG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMUB2Q71RG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMUB2Q71RG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMUB2Q71RG4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms