Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PDZRN4Q6ZMN7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDZRN4Q6ZMN7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDZRN4Q6ZMN7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms