Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMD2

SPNS3, Protein spinster homolog 3, humanhuman

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3Q6ZMD2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPNS3Q6ZMD2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPNS3Q6ZMD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPNS3Q6ZMD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPNS3Q6ZMD2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPNS3Q6ZMD2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
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