Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6Q795 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6Q795 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6Q795 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6Q795 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6Q795 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6Q795 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6Q795 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q6Q795 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q6Q795 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q6Q795 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6Q795 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6Q795 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6Q795 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q6Q795 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6Q795 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6Q795 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6Q795 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q6Q795 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q6Q795 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6Q795 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6Q795 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q6Q795 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6Q795 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q6Q795 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6Q795 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6Q795 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6Q795 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6Q795 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6Q795 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6Q795 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6Q795 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6Q795 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6Q795 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6Q795 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6Q795 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6Q795 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6Q795 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6Q795 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6Q795 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6Q795 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6Q795 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6Q795 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6Q795 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6Q795 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6Q795 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6Q795 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6Q795 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms