Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4F2

FDX2, Ferredoxin-2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDX2Q6P4F2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FDX2Q6P4F2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FDX2Q6P4F2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FDX2Q6P4F2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FDX2Q6P4F2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms