Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.399e-19■■■■■ 69.6
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PRPF8Q6P2Q9 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.379e-19■■■■■ 69.6
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PRPF8Q6P2Q9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 68.1
PRPF8Q6P2Q9 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 68
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PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-205ENST00000398169 1631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.979e-8■■■■■ 67.3
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-203ENST00000398160 1613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.139e-8■■■■■ 67.3
PRPF8Q6P2Q9 CCNB1IP1-204ENST00000398163 1604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.159e-8■■■■■ 67.3
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