Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF544Q6NX49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF544Q6NX49 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF544Q6NX49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF544Q6NX49 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms