Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC42.08■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CARMIL1Q5VZK9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CARMIL1Q5VZK9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.94■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
CARMIL1Q5VZK9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
CARMIL1Q5VZK9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CARMIL1Q5VZK9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.27
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CARMIL1Q5VZK9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
CARMIL1Q5VZK9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CARMIL1Q5VZK9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms