Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMTC4Q5T4D3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMTC4Q5T4D3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMTC4Q5T4D3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMTC4Q5T4D3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMTC4Q5T4D3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMTC4Q5T4D3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMTC4Q5T4D3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMTC4Q5T4D3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMTC4Q5T4D3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms