Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q3C1V9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q3C1V9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q3C1V9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Q3C1V9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q3C1V9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q3C1V9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q3C1V9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q3C1V9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q3C1V9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Q3C1V9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q3C1V9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q3C1V9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q3C1V9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3C1V9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3C1V9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3C1V9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q3C1V9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3C1V9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q3C1V9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Q3C1V9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q3C1V9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3C1V9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3C1V9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q3C1V9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3C1V9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3C1V9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q3C1V9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3C1V9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3C1V9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3C1V9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q3C1V9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q3C1V9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3C1V9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q3C1V9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q3C1V9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q3C1V9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q3C1V9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q3C1V9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3C1V9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3C1V9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3C1V9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q3C1V9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3C1V9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q3C1V9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3C1V9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3C1V9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q3C1V9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3C1V9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3C1V9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3C1V9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3C1V9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q3C1V9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Q3C1V9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3C1V9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3C1V9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Q3C1V9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q3C1V9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Q3C1V9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3C1V9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3C1V9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Q3C1V9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3C1V9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Q3C1V9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms