Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV1

NBPF20, Neuroblastoma breakpoint family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF20Q3BBV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NBPF20Q3BBV1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NBPF20Q3BBV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NBPF20Q3BBV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NBPF20Q3BBV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NBPF20Q3BBV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms