Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NKX1-1Q15270 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NKX1-1Q15270 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NKX1-1Q15270 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NKX1-1Q15270 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NKX1-1Q15270 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NKX1-1Q15270 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms