Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SHPRHQ149N8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SHPRHQ149N8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SHPRHQ149N8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SHPRHQ149N8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SHPRHQ149N8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SHPRHQ149N8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
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