Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMC1AQ14683 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMC1AQ14683 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMC1AQ14683 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMC1AQ14683 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
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