Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
IRF5Q13568 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IRF5Q13568 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IRF5Q13568 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRF5Q13568 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
IRF5Q13568 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRF5Q13568 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
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