Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPRSQ13332 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPRSQ13332 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPRSQ13332 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRSQ13332 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRSQ13332 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTPRSQ13332 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRSQ13332 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRSQ13332 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRSQ13332 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRSQ13332 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRSQ13332 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRSQ13332 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRSQ13332 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRSQ13332 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTPRSQ13332 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRSQ13332 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRSQ13332 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRSQ13332 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRSQ13332 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRSQ13332 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRSQ13332 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRSQ13332 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms