Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD3Q12873 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHD3Q12873 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHD3Q12873 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CHD3Q12873 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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