Protein–RNA interactions for Protein: Q12306

SMT3, Ubiquitin-like protein SMT3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMT3Q12306 HRA1HRA1 564 nt6.12□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 PET10YKR046C 852 nt6.12□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 TPI1YDR050C 747 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 ADH3YMR083W 1128 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 RFS1YBR052C 633 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 AOS1YPR180W 1044 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 FCP1YMR277W 2199 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 YBL111CYBL111C 2004 nt6.11□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 FLC2YAL053W 2352 nt6.1□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 FUN14YAL008W 597 nt6.1□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 HAM1YJR069C 594 nt6.1□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 GCD11YER025W 1584 nt6.1□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 THI73YLR004C 1572 nt6.1□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 OCH1YGL038C 1443 nt6.09□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 MSS51YLR203C 1311 nt6.09□□□□□ -1.43
SMT3Q12306 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.08□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 YHR033WYHR033W 1272 nt6.08□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 MOB1YIL106W 945 nt6.08□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 SHC1YER096W 1539 nt6.08□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 HNM1YGL077C 1692 nt6.07□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 ENB1YOL158C 1821 nt6.07□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 SRP102YKL154W 735 nt6.07□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 PRE10YOR362C 867 nt6.07□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 CKI1YLR133W 1749 nt6.06□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 MNN9YPL050C 1188 nt6.06□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 ECM10YEL030W 1935 nt6.05□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 PPS1YBR276C 2424 nt6.05□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 VPS65YLR322W 315 nt6.05□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 CAR2YLR438W 1275 nt6.05□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 IGD1YFR017C 588 nt6.04□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 TIM50YPL063W 1431 nt6.04□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 ARG7YMR062C 1326 nt6.03□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 LOT6YLR011W 576 nt6.03□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 YLR280CYLR280C 351 nt6.03□□□□□ -1.44
SMT3Q12306 MSB3YNL293W 1902 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YCR041WYCR041W 333 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YDR215CYDR215C 414 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YDR327WYDR327W 327 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 TRR1YDR353W 960 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YPT31YER031C 672 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 NAP1YKR048C 1254 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 BXI1YNL305C 894 nt6.02□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 CAK1YFL029C 1107 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 DST1YGL043W 930 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 PAC10YGR078C 600 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 CYC3YAL039C 810 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 PRY2YKR013W 990 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YMR166CYMR166C 1107 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 CDC13YDL220C 2775 nt6.01□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 SRF1YDL133W 1314 nt6□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YGL260WYGL260W 231 nt6□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 PMU1YKL128C 888 nt6□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 AIM2YAL049C 741 nt6□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YAH1YPL252C 519 nt6□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 FCY2YER056C 1602 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 PPZ2YDR436W 2133 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 FLX1YIL134W 936 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YKL147CYKL147C 618 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YOR012WYOR012W 414 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 ADE2YOR128C 1716 nt5.99□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 SNF4YGL115W 969 nt5.98□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 CPR2YHR057C 618 nt5.98□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 YLR112WYLR112W 420 nt5.98□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 ERO1YML130C 1692 nt5.98□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 RRT14YIL127C 621 nt5.97□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 ERV25YML012W 636 nt5.97□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 MAM3YOL060C 2121 nt5.97□□□□□ -1.45
SMT3Q12306 NUP57YGR119C 1626 nt5.96□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 SSC1YJR045C 1965 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 HHY1YEL059W 309 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 MEU1YLR017W 1014 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 CDC3YLR314C 1563 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 LIP5YOR196C 1245 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 YPC1YBR183W 951 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 SNU66YOR308C 1764 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 JHD1YER051W 1479 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 ERG24YNL280C 1317 nt5.95□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 YOR389WYOR389W 1875 nt5.94□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 ICL2YPR006C 1728 nt5.94□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 KIN1YDR122W 3195 nt5.93□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 CCR4YAL021C 2514 nt5.93□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 SEC23YPR181C 2307 nt5.93□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 EDC3YEL015W 1656 nt5.92□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 ADH7YCR105W 1086 nt5.92□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 CPD1YGR247W 720 nt5.92□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 DAL80YKR034W 810 nt5.92□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 AFG3YER017C 2286 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 EFM1YHL039W 1758 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt5.91□□□□□ -1.46
SMT3Q12306 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms