Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.46□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 WSC4YHL028W 1818 nt7.45□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 BUD20YLR074C 501 nt7.45□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 DIA4YHR011W 1341 nt7.45□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 KTR4YBR199W 1395 nt7.45□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 YOR343CYOR343C 327 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 MNN9YPL050C 1188 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 GCD11YER025W 1584 nt7.44□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 ADE1YAR015W 921 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 NUP53YMR153W 1428 nt7.4□□□□□ -1.22
RRP42Q12277 ECM10YEL030W 1935 nt7.39□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 APT1YML022W 564 nt7.39□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 PSP2YML017W 1782 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 MTC6YHR151C 1581 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 TOS1YBR162C 1368 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 MET30YIL046W 1923 nt7.38□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 ADE16YLR028C 1776 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 SPR1YOR190W 1338 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 YJL043WYJL043W 774 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 YNL190WYNL190W 615 nt7.36□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 HAC1YFL031W 717 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 CDA1YLR307W 906 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 ELP6YMR312W 822 nt7.35□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 DST1YGL043W 930 nt7.34□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 TES1YJR019C 1050 nt7.34□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 HAM1YJR069C 594 nt7.34□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 CPT1YNL130C 1182 nt7.34□□□□□ -1.23
RRP42Q12277 PNS1YOR161C 1620 nt7.34□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 SNU66YOR308C 1764 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 LAS17YOR181W 1902 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 RPL12BYDR418W 498 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 YDR476CYDR476C 675 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 AOS1YPR180W 1044 nt7.33□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 ADE2YOR128C 1716 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 PMA2YPL036W 2844 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 CPR2YHR057C 618 nt7.32□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 FUS3YBL016W 1062 nt7.31□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 YHR033WYHR033W 1272 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 PET494YNR045W 1470 nt7.3□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 CKB1YGL019W 837 nt7.29□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 RRT6YGL146C 936 nt7.29□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.29□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 DUS3YLR401C 2007 nt7.28□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 MDH2YOL126C 1134 nt7.28□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 FRT1YOR324C 1809 nt7.28□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 AVL9YLR114C 2295 nt7.27□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 STE3YKL178C 1413 nt7.27□□□□□ -1.24
RRP42Q12277 INP54YOL065C 1155 nt7.27□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 MAM3YOL060C 2121 nt7.27□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 KAE1YKR038C 1161 nt7.26□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 TPO1YLL028W 1761 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 RRP43YCR035C 1185 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 PET10YKR046C 852 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 NDE1YMR145C 1683 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 YNL295WYNL295W 1575 nt7.25□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 STS1YIR011C 960 nt7.24□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 MET13YGL125W 1803 nt7.24□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 YPC1YBR183W 951 nt7.23□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 PFS2YNL317W 1398 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 RSC9YML127W 1746 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 YDR306CYDR306C 1437 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 PSA1YDL055C 1086 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 EDC2YER035W 438 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 ERV2YPR037C 591 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 HSV2YGR223C 1347 nt7.22□□□□□ -1.25
RRP42Q12277 GET2YER083C 858 nt7.21□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YLR358CYLR358C 564 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 ERV25YML012W 636 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 RCF2YNR018W 675 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YPT10YBR264C 600 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 PMT1YDL095W 2454 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 LEO1YOR123C 1395 nt7.2□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 SPS1YDR523C 1473 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 NCA3YJL116C 1014 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.19□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 PEX28YHR150W 1740 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 OSM1YJR051W 1506 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 DAL80YKR034W 810 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 CAR2YLR438W 1275 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 PMT7YDR307W 1989 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 PPZ2YDR436W 2133 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 CCR4YAL021C 2514 nt7.18□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 SLM3YDL033C 1254 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YDR215CYDR215C 414 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YJR142WYJR142W 1029 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 CRN1YLR429W 1956 nt7.17□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 DSC3YOR223W 879 nt7.16□□□□□ -1.26
RRP42Q12277 YGL081WYGL081W 963 nt7.15□□□□□ -1.26
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