Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 MRN1YPL184C 1839 nt7.45□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 MET30YIL046W 1923 nt7.44□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 PFS2YNL317W 1398 nt7.44□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 ATP2YJR121W 1536 nt7.43□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 ARO3YDR035W 1113 nt7.43□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 UTR5YEL035C 501 nt7.43□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 SNU66YOR308C 1764 nt7.43□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 JHD1YER051W 1479 nt7.43□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 COG1YGL223C 1254 nt7.41□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 DIA4YHR011W 1341 nt7.41□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 ALG7YBR243C 1347 nt7.41□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 LAS17YOR181W 1902 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 SNP1YIL061C 903 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 KTR4YBR199W 1395 nt7.4□□□□□ -1.22
NMD4Q12129 WSC4YHL028W 1818 nt7.4□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 ADA2YDR448W 1305 nt7.39□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 GRH1YDR517W 1119 nt7.39□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 ATG22YCL038C 1587 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 ARG7YMR062C 1326 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 FAF1YIL019W 1041 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 YIL168WYIL168W 384 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 TDH1YJL052W 999 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 MNN9YPL050C 1188 nt7.38□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 YKR023WYKR023W 1593 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 HSV2YGR223C 1347 nt7.37□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 UBP13YBL067C 2244 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 GDH1YOR375C 1365 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 MDH2YOL126C 1134 nt7.36□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 YJL045WYJL045W 1905 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 MRP1YDR347W 966 nt7.35□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 RTG2YGL252C 1767 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 SLM3YDL033C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 TAD2YJL035C 753 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 AIM34YMR003W 597 nt7.34□□□□□ -1.23
NMD4Q12129 ELP4YPL101W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 MTC6YHR151C 1581 nt7.33□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 ADE2YOR128C 1716 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 IDP3YNL009W 1263 nt7.32□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 HRA1HRA1 564 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 PMT7YDR307W 1989 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 ITR1YDR497C 1755 nt7.31□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 ELP6YMR312W 822 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 PAU21YOR394W 495 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 PAU22YPL282C 495 nt7.3□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 TES1YJR019C 1050 nt7.29□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 APT1YML022W 564 nt7.28□□□□□ -1.24
NMD4Q12129 DST1YGL043W 930 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 HAM1YJR069C 594 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 CDA1YLR307W 906 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 YTH1YPR107C 627 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 AOS1YPR180W 1044 nt7.27□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 BUD20YLR074C 501 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 TOP3YLR234W 1971 nt7.26□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 PSP2YML017W 1782 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 PRC1YMR297W 1599 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 PMA2YPL036W 2844 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 ADE1YAR015W 921 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 YOR343CYOR343C 327 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 NUP53YMR153W 1428 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 SPR1YOR190W 1338 nt7.25□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 AVL9YLR114C 2295 nt7.24□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 CKB1YGL019W 837 nt7.24□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 CPR2YHR057C 618 nt7.24□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 TOS1YBR162C 1368 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 FRT1YOR324C 1809 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 GCD11YER025W 1584 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 PNS1YOR161C 1620 nt7.23□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 YHR033WYHR033W 1272 nt7.22□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 YJL043WYJL043W 774 nt7.22□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 CPT1YNL130C 1182 nt7.22□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 MET13YGL125W 1803 nt7.22□□□□□ -1.25
NMD4Q12129 HAC1YFL031W 717 nt7.21□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 RMA1YKL132C 1293 nt7.21□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YEL023CYEL023C 2049 nt7.21□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 TPO1YLL028W 1761 nt7.2□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 SGV1YPR161C 1974 nt7.2□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 BEM1YBR200W 1656 nt7.2□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YDR476CYDR476C 675 nt7.2□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.2□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 STE3YKL178C 1413 nt7.19□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 RSC9YML127W 1746 nt7.19□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 CHA1YCL064C 1083 nt7.19□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 MAM3YOL060C 2121 nt7.18□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 PMT1YDL095W 2454 nt7.18□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.18□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.18□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 YNL295WYNL295W 1575 nt7.17□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 PET10YKR046C 852 nt7.17□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 INP54YOL065C 1155 nt7.17□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 RRP43YCR035C 1185 nt7.16□□□□□ -1.26
NMD4Q12129 GGC1YDL198C 903 nt7.16□□□□□ -1.26
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