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Protein–RNA interactions for Protein: Q08729
DSE3, Protein DSE3, yeast
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430 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE3
Q08729
tD(GUC)K
tD(GUC)K
72 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
tD(GUC)L1
tD(GUC)L1
72 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
tD(GUC)L2
tD(GUC)L2
72 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
tD(GUC)M
tD(GUC)M
72 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
tD(GUC)O
tD(GUC)O
72 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
INM1
YHR046C
888 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
YNL140C
YNL140C
570 nt
8.6
□□□□□ -1.03
DSE3
Q08729
TIF3
YPR163C
1311 nt
8.58
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
DST1
YGL043W
930 nt
8.58
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
SDH8
YBR269C
417 nt
8.58
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
MTC6
YHR151C
1581 nt
8.55
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
HOG1
YLR113W
1308 nt
8.54
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
CPR2
YHR057C
618 nt
8.53
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
ELP6
YMR312W
822 nt
8.53
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
YPL247C
YPL247C
1572 nt
8.52
□□□□□ -1.04
DSE3
Q08729
YML034C-A
YML034C-A
399 nt
8.52
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
STE3
YKL178C
1413 nt
8.52
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
MIM1
YOL026C
342 nt
8.51
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
ERV2
YPR037C
591 nt
8.51
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
RRP43
YCR035C
1185 nt
8.5
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
YML079W
YML079W
606 nt
8.5
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
YNL295W
YNL295W
1575 nt
8.5
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
CRN1
YLR429W
1956 nt
8.5
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
KTR4
YBR199W
1395 nt
8.49
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
ORT1
YOR130C
879 nt
8.49
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
FRA1
YLL029W
2250 nt
8.49
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
TES1
YJR019C
1050 nt
8.48
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
YJR142W
YJR142W
1029 nt
8.48
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
AOS1
YPR180W
1044 nt
8.48
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
HAM1
YJR069C
594 nt
8.47
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
RPR1
RPR1
369 nt
8.47
□□□□□ -1.05
DSE3
Q08729
HBS1
YKR084C
1836 nt
8.46
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
PSA1
YDL055C
1086 nt
8.46
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
DOC1
YGL240W
753 nt
8.46
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
MCM5
YLR274W
2328 nt
8.46
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
NMA2
YGR010W
1188 nt
8.45
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
STS1
YIR011C
960 nt
8.45
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
INP54
YOL065C
1155 nt
8.45
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
PUP2
YGR253C
783 nt
8.43
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
DUR3
YHL016C
2208 nt
8.42
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
PIH1
YHR034C
1035 nt
8.42
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
SPS1
YDR523C
1473 nt
8.42
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
CDA1
YLR307W
906 nt
8.41
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
ATP23
YNR020C
813 nt
8.41
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
snR4
snR4
186 nt
8.41
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
OSM1
YJR051W
1506 nt
8.4
□□□□□ -1.06
DSE3
Q08729
TPO1
YLL028W
1761 nt
8.4
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YOR072W
YOR072W
315 nt
8.39
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
MSI1
YBR195C
1269 nt
8.39
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
HRB1
YNL004W
1365 nt
8.38
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YGL081W
YGL081W
963 nt
8.38
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YHR033W
YHR033W
1272 nt
8.38
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
ADH6
YMR318C
1083 nt
8.38
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
PPZ2
YDR436W
2133 nt
8.38
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
MAS2
YHR024C
1449 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
CDC3
YLR314C
1563 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YAL019W-A
YAL019W-A
570 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
COS10
YNR075W
1125 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YPC1
YBR183W
951 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YRF1-3
YGR296W
5580 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YRF1-6
YNL339C
5580 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YRF1-7
YPL283C
5580 nt
8.37
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
UME1
YPL139C
1383 nt
8.36
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
ERV25
YML012W
636 nt
8.36
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YPT10
YBR264C
600 nt
8.36
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
CKI1
YLR133W
1749 nt
8.36
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
AVL9
YLR114C
2295 nt
8.34
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
YBL111C
YBL111C
2004 nt
8.34
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
SLM3
YDL033C
1254 nt
8.34
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
GET2
YER083C
858 nt
8.34
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
DAL80
YKR034W
810 nt
8.34
□□□□□ -1.07
DSE3
Q08729
SKP1
YDR328C
585 nt
8.33
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
CYS3
YAL012W
1185 nt
8.33
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
DSC3
YOR223W
879 nt
8.33
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
DIA4
YHR011W
1341 nt
8.32
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
PRY2
YKR013W
990 nt
8.32
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
MAS1
YLR163C
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8.32
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
RPL2A
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8.31
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
MEX67
YPL169C
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8.31
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
PMT1
YDL095W
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8.3
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
CKB1
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8.3
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
NSG2
YNL156C
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8.3
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
YPQ1
YOL092W
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8.3
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
PTH2
YBL057C
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8.29
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
LAT1
YNL071W
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8.29
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
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YLR322W
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□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
YOX1
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□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
YPL067C
YPL067C
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8.28
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
PEX28
YHR150W
1740 nt
8.28
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
YIL177C
YIL177C
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8.27
□□□□□ -1.08
DSE3
Q08729
ALD5
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8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
YDR215C
YDR215C
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8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
PIL1
YGR086C
1020 nt
8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
PET10
YKR046C
852 nt
8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
MBF1
YOR298C-A
456 nt
8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
BDS1
YOL164W
1941 nt
8.27
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
OPI1
YHL020C
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8.26
□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
MET13
YGL125W
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□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
TRR2
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□□□□□ -1.09
DSE3
Q08729
RCF2
YNR018W
675 nt
8.25
□□□□□ -1.09
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