Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE4CQ08493 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDE4CQ08493 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE4CQ08493 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4CQ08493 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms