Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ATP7AQ04656 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ATP7AQ04656 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ATP7AQ04656 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
ATP7AQ04656 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ATP7AQ04656 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATP7AQ04656 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
ATP7AQ04656 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms