Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 LAS17YOR181W 1902 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 RUP1YOR138C 2016 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 YJL160CYJL160C 864 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 AVL9YLR114C 2295 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 MET30YIL046W 1923 nt6.25□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 YPL264CYPL264C 1062 nt6.24□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 YER152CYER152C 1332 nt6.24□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.23□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 TES1YJR019C 1050 nt6.23□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 PET18YCR020C 648 nt6.22□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 SNA3YJL151C 402 nt6.22□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 JHD1YER051W 1479 nt6.22□□□□□ -1.41
YHP1Q04116 BXI1YNL305C 894 nt6.21□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 PRE10YOR362C 867 nt6.21□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YPT31YER031C 672 nt6.2□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YER156CYER156C 1017 nt6.2□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 ALR1YOL130W 2580 nt6.2□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YLR030WYLR030W 792 nt6.19□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 SPE4YLR146C 903 nt6.19□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 MFT1YML062C 1179 nt6.19□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 AOS1YPR180W 1044 nt6.19□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YPR084WYPR084W 1371 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 GRH1YDR517W 1119 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 DST1YGL043W 930 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 VPS65YLR322W 315 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 RPS6AYPL090C 711 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 RPS6BYBR181C 711 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 TOP3YLR234W 1971 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 ARG7YMR062C 1326 nt6.18□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 CHA1YCL064C 1083 nt6.17□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 HAM1YJR069C 594 nt6.17□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 BUD20YLR074C 501 nt6.17□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 RTG2YGL252C 1767 nt6.16□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 PMU1YKL128C 888 nt6.16□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YMR206WYMR206W 942 nt6.16□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 RCF2YNR018W 675 nt6.16□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YBL113CYBL113C 2379 nt6.16□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YLR173WYLR173W 1827 nt6.15□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 ATP2YJR121W 1536 nt6.15□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 CPR2YHR057C 618 nt6.15□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 HRA1HRA1 564 nt6.15□□□□□ -1.42
YHP1Q04116 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.14□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YOR343CYOR343C 327 nt6.14□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 PAU21YOR394W 495 nt6.14□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 PAU22YPL282C 495 nt6.14□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 LEO1YOR123C 1395 nt6.14□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 TCB1YOR086C 3561 nt6.13□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YDR215CYDR215C 414 nt6.13□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 MRP1YDR347W 966 nt6.13□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YKR018CYKR018C 2178 nt6.13□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ADA2YDR448W 1305 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 UTR5YEL035C 501 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 GNA1YFL017C 480 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YHR033WYHR033W 1272 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ERV25YML012W 636 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 MNN9YPL050C 1188 nt6.12□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 GDH1YOR375C 1365 nt6.11□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YJL043WYJL043W 774 nt6.11□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 PET10YKR046C 852 nt6.11□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ATP10YLR393W 840 nt6.11□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 MAL31YBR298C 1845 nt6.11□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 HNM1YGL077C 1692 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ERR3YMR323W 1314 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ERR1YOR393W 1314 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 ERR2YPL281C 1314 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 SNF7YLR025W 723 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YMR253CYMR253C 1245 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 CKI1YLR133W 1749 nt6.1□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 TAD2YJL035C 753 nt6.09□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 YOR041CYOR041C 432 nt6.09□□□□□ -1.43
YHP1Q04116 DCR2YLR361C 1737 nt6.08□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 TPI1YDR050C 747 nt6.08□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 SEC24YIL109C 2781 nt6.08□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 ELP4YPL101W 1371 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 CDC23YHR166C 1881 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 TDH1YJL052W 999 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 CAR2YLR438W 1275 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 STE3YKL178C 1413 nt6.07□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 RPL12BYDR418W 498 nt6.06□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 APT1YML022W 564 nt6.06□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 GTS1YGL181W 1191 nt6.05□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 YPC1YBR183W 951 nt6.05□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 MSS51YLR203C 1311 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 AQR1YNL065W 1761 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 PRB1YEL060C 1908 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 YIL168WYIL168W 384 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 DAL80YKR034W 810 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 FLC2YAL053W 2352 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 PMA2YPL036W 2844 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 GNP1YDR508C 1992 nt6.04□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 YNL295WYNL295W 1575 nt6.03□□□□□ -1.44
YHP1Q04116 YGL260WYGL260W 231 nt6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 95.3 ms