Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGFBR3Q03167 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGFBR3Q03167 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGFBR3Q03167 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGFBR3Q03167 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms