Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POU5F1Q01860 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POU5F1Q01860 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POU5F1Q01860 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POU5F1Q01860 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
POU5F1Q01860 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POU5F1Q01860 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
POU5F1Q01860 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POU5F1Q01860 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.56■■■□□ 2
POU5F1Q01860 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POU5F1Q01860 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
POU5F1Q01860 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POU5F1Q01860 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POU5F1Q01860 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POU5F1Q01860 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POU5F1Q01860 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POU5F1Q01860 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POU5F1Q01860 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POU5F1Q01860 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POU5F1Q01860 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POU5F1Q01860 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POU5F1Q01860 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POU5F1Q01860 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms