Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MC1RQ01726 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MC1RQ01726 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MC1RQ01726 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MC1RQ01726 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MC1RQ01726 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms