Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX4P78413 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX4P78413 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX4P78413 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX4P78413 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX4P78413 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX4P78413 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX4P78413 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX4P78413 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX4P78413 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX4P78413 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX4P78413 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX4P78413 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IRX4P78413 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX4P78413 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX4P78413 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX4P78413 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX4P78413 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX4P78413 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX4P78413 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX4P78413 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX4P78413 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX4P78413 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX4P78413 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX4P78413 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX4P78413 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX4P78413 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX4P78413 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX4P78413 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX4P78413 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX4P78413 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX4P78413 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX4P78413 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX4P78413 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX4P78413 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX4P78413 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX4P78413 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX4P78413 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX4P78413 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX4P78413 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX4P78413 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX4P78413 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX4P78413 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX4P78413 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX4P78413 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX4P78413 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX4P78413 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX4P78413 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX4P78413 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX4P78413 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX4P78413 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX4P78413 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX4P78413 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX4P78413 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX4P78413 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX4P78413 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX4P78413 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX4P78413 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IRX4P78413 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX4P78413 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX4P78413 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX4P78413 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX4P78413 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX4P78413 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms