Protein–RNA interactions for Protein: P78324

SIRPA, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPAP78324 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SIRPAP78324 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SIRPAP78324 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SIRPAP78324 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIRPAP78324 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms